酶膜反应器是一种新型的具有生物反应、分离、浓缩、回收功能的生物反应器，主要进行超滤（UF）、纳滤（NF）、反渗透（RO）的分离纯化，对于以水为溶剂的液体可以进行过滤、脱色、脱盐、提纯、浓缩。
反应器可以根据酶的存在状态、液相数目、膜组件型式、膜材料类型等的区别，分为不同的类型:
1、根据酶的存在状态，可将酶膜反应器分为游离态和固定化反应器。前者酶均匀地分布于反应物相中，酶促反应在接近本征动力学的状态下进行，但酶易发生剪切失活或泡沫变性，装置性能受浓差极化和膜污染的显著影响。
固定化反应器中，酶通过吸附、交联、包埋、化学键合等方式被“束缚”在膜上，酶装填密度高，反应器稳定性和生产能力高，产品纯度和质量好，废物量少。但酶往往分布不均匀，传质阻力也较大。
2、根据液相数目的不同，可将酶膜反应器分为单液相(超滤式)和双液相反应器。单液相反应器多用于底物分子量比产物大得多，产物和底物能够溶于同一种溶剂的场合。双液相反应器多用于酶促反应涉及两种或两种以上的底物，而底物之间或底物与产物之间的溶解行为差别较大的场合。
3、根据膜组件型式的不同，可将应器分为板框式、螺旋卷式、管式和中空纤维式反应器四种。其差别在于结构复杂性、装填密度、膜的更换、抗污染能力、清洗、料液要求、成本等方面有所不同。
4、根据膜材料的不同，可将反应器分为高分子反应器和无机反应器。高分子膜材料种类多，制作方便，成本低，因而应用较多。
另外，可以根据膜的亲疏性以及结构形态的不同，酶膜反应器还有其它分类方法。
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